Proteins are complex molecules that form the building blocks of living things, they are made up of hundreds or thousands of smaller units called amino acids that are linked together in long chains, there are twenty different types of these amino acids and the unique way they are sequenced defines the function of the protein.
Las proteínas son moléculas complejas que forman los bloques de construcción de los seres vivos, están formadas por cientos o miles de unidades más pequeñas llamadas aminoácidos que se unen entre sí en largas cadenas, existen veinte tipos diferentes de estos aminoácidos y la forma única en que van secuenciados define la función de la proteína.
But what is really complex about proteins is not the sequence in which the amino acids are joined, but the three-dimensional structure that they adopt once the sequence is complete, this structure depends on the amino acid sequence and is also unique for each protein, defining its subsequent function inside the body.
Pero lo realmente complejo de las proteínas no es la secuencia en la que se unen los aminoácidos sino la estructura tridimensional que adoptan una vez terminada la secuencia, esta estructura depende de la secuencia de los aminoácidos y también es única para cada proteína definiendo su función posterior dentro del cuerpo.
If we could guess the way the protein will fold based simply on the sequence in which the amino acids are chained together, not only would we be able to learn what existing proteins do, but we could design proteins on demand to perform the specific tasks designed for them by the experts and this is where artificial intelligence comes in.
Si pudiésemos adivinar la forma en que la proteína se plegará basándonos simplemente en la secuencia en la que están encadenados los aminoácidos, no solo podríamos saber cual es la función de las proteínas existentes sino que podríamos diseñar proteínas a la carta que realizasen las tareas específicas diseñadas por los expertos y aquí en donde entra la inteligencia artificial.
Five years ago, in 2018, DeepMind, a subsidiary of Google, presented AlphaFold, the first artificial intelligence model to predict the structure of proteins from their amino acid sequence, followed by AlphaFold 2 in 2020, whose accuracy stunned experts with a score of 90/100 in the tests carried out.
Hace ya cinco años, en 2018, DeepMind, filial de Google, presentó AlphaFold el primer modelo de inteligencia artificial en predecir la estructura de las proteínas a partir de su secuencia de aminoácidos, seguido por AlphaFold 2 en 2020 cuya precisión dejó pasmados a los expertos con una puntuación de 90/100 en las pruebas realizadas.
In November 2022, Meta, Mark Zuckerberg's company, presented ESMFold, a new artificial intelligence model to predict protein structures, based on language management models, this AI is capable of auto-complete amino acid sequences, including proteins unknowns and predict their structure.
En noviembre de 2022 Meta, la empresa de Mark Zuckerberg, presentó ESMFold un nuevo modelo de inteligencia artificial para predecir las estructuras de las proteínas, basado en modelos de manejo de lenguaje esta IA es capaz de auto-completar secuencias de aminoácidos, incluso de proteínas desconocidas y predecir su estructura.
The best of all this is that Deepmind, which has now got a tough competitor, will have to redouble its efforts to take over the market, which will result in spectacular progress in understanding the functioning of the biology of living beings and in the design of drugs that help us end diseases.
Lo mejor de todo esto es que Deepmind, que ahora le ha salido un duro competidor, tendrá que redoblar sus esfuerzos para hacerse con el mercado ,lo que redundará en un avance espectacular en la comprensión del funcionamiento de la biología de los seres vivos y en el diseño de fármacos que nos ayuden a acabar con las enfermedades.
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https://www.wsj.com/articles/meta-ai-unlocks-hundreds-of-millions-of-proteins-to-aid-drug-discovery-d0ef32fa