Clostridium difficile es una especie bacteriana del género Clostridium, que son bacilos gram positivos formadores de esporas, anaerobios estrictos. C. difficile es parte de la microbiana intestinal normal en un pequeño número de individuos sanos y de pacientes hospitalizados. C. difficile es la causa más importante de colitis seudomembranosa, una infección del colon, con frecuencia secundaria a la erradicación de la flora saprófita por el uso extenso de antibióticos. El tratamiento, por lo general, está basado en suspender los antibióticos, con excepción de anti-clostridiales, como el metronidazol.