什麼是Gephi

Gephi就是一個專門製作網絡圖的一個程式，它比Python的Networkx相比下互動性很大，而且不用任何coding也可以做出（更美觀的）結果。建議可以結合Python跟Gephi一起用~

Gephi要怎麼用

首先把Python裡的社會網絡數據導出為graphml的格式：

在你把網絡都定義好以後，用nx.write_graphml()就可以，還是繼續用上次的例子吧。

import networkx as nx

G=nx.DiGraph()

G.add_edge('A','B',weight=1)
G.add_edge('A','C',weight=1)
G.add_edge('A','D',weight=1)
G.add_edge('A','E',weight=1)
G.add_edge('A','F',weight=1)
G.add_edge('A','G',weight=1)
G.add_edge('I','H',weight=1)
G.add_edge('J','H',weight=1)
G.add_edge('K','H',weight=1)
G.add_edge('M','H',weight=1)
G.add_edge('N','H',weight=1)
G.add_edge('O','H',weight=1)
G.add_edge('P','Q',weight=1)
G.add_edge('P','R',weight=1)
G.add_edge('A','H',weight=3)
G.add_edge('P','H',weight=0.5)
G.add_edge('B','C',weight=1)
G.add_edge('D','F',weight=1)
G.add_edge('B','G',weight=1)

nx.write_graphml(G, 'sn1.graphml') // 把網絡以graphml的方式導出

在這裡我把G導出成一個名叫sn1的graphml檔案。

從Gephi的官網你可以免費下載程式: https://gephi.org/

安裝後直接就可以用Gephi把sn1打開，打開以後會看到以下一個視窗：

因為我在Python裡已把G定義為有向圖，所以你會看到導入時它會自動把Graph Type選成Directed。你也可以在這裡看到G裡面有17個個體 (node)跟19個連結(edge)。沒有問題的話按OK即可。

接著應該會看到這樣一個畫面：

中間的那個就是網絡圖G了，看起來很混亂的一個狀態，這是因為我們沒有定義G的佈圖。在左邊可以選擇Layout，我用了Yifan Hu這個佈圖以後就會看到一個比較能看的東西：

如果你對某些個體的位置覺得不滿意，可以直接在圖中拖放他們作調整。

接下來就可以把這個網絡圖改動一下。

在左上方有一個叫Appearance的框，用來調整個體或個體間的連結：

在改動個體的外觀時，有4個方面可以調整（在框的右上方），分別為個體的顏色、個體的大小、標籤的顏色跟標籤的大小；
類似的，在改動連結的外觀時，則有3個方面可以調整，分別為連結的顏色、標籤的顏色跟標籤的大小。
改完以後按右下的Apply就可以看到結果了。

每一個方面都有2種調整的方法，分別為Unique跟Attribute，每個方面只能用其中一種方法。Unique的意思就是作統一的改動，如果我把個體顏色設定為Unique黃色，那麼所有的個體都會變成黃色。Attribute的意思是每個個體會根據一些參數作相應的調整，這個在下面用例子解釋吧。

假設現在我把個體都改成Unique藍色，個體標籤改成Unique綠色、連結沿用Unique黑色，那網絡圖就會改成：

這個圖看起來每一個個體都是一樣大小的，但我想從個體的大小把它的重要性顯示出來，這時候就用Attribute這個方法了。

我在Nodes的Size方面選Attribute就可以選擇用什麼參數去決定個體的大小，可以選Degree、In-Degree跟Out-Degree。

我來說明一下它們的意思：一個個體的In-Degree就是有多少個其他個體指向它；Out-Degree就是它指向多少個其他個體；而Degree就是In-Degree跟Out-Degree的總和。

我們這裡就選Degree去代表一個人的重要性好了，把個體的Min Size設成15，Max Size設成55。同樣的，我們把標籤調整為用Degree去決定大小，Min size定為0.5，Max size定為2。

設定好以後，在圖的下方你也能看到一些按鈕，把黑色的T按了就能在圖中看到個體標籤了，白色T的右邊的slide bar是用來調整連結的大小的，按自己喜好調整就好。

完成以後圖片就變這樣了：

在這裡你看到H是最大的，因為他的Degree是所有個體中最大 (Degree = 8)。

除了Overview以外，我們也可以看一下Data Laboratory：

裡面記錄了原始數據，比如你選Edges來看的話就會看到連結之間的加權

你也可以在這裡加新的個體、新的連結、修改加權等等，或是在左方把一些外觀的設定改過來。

在這裡我就把3組再編為不同的顏色，就能看到以下結果(其實不怎美觀，原諒我的美術天份 ....)：

最後，Preview那邊可以作一些最後調整，並把網絡圖導出，那邊相當容易理解一些，就不在這詳細解釋了。

你會留意到在Overview的介面中，右邊有一個叫Filter的東西可以把個體作篩選。這個東西在數據量大的時候就很有用 (比如用Steemit的數據)。比如我把Filter裡面選Topology -> Degree Range這個東西拉到下面的Queries去，就可以選擇在圖中保留Degree有一定程度的個體：