Apparaissant de février à avril, ce sont de magnifiques fleurs dressées composées de 5 pétales linéaires rouge et d’une centaine de filets d’étamines jaune.
Elles s’ouvrent au coucher de soleil et fanent dès le lendemain matin. Par ses couleurs chatoyantes, son odeur semblable au Jasmin et ses délicieux sucs, elles attirent des Sphinx nocturnes qui sont des papillons de nuit qui viennent les polliniser.
A Mayotte, en l’absence des fleurs, il est impossible de faire la différence entre le Baobab africain (Adansonia digitata) et le Baobab malgache (Adansonia madagascariensis) tant ce dernier ressemble morphologiquement à certains spécimens du Baobab africain. Seul l'observation de ces fleurs rouge permet de distinguer ces deux espèces de Baobabs.