Essas aves desempenham importantes funções ecológicas nos ecossistemas em que estão inseridas. As diferentes guildas alimentares das aves aquáticas que existem, como detritívoras (se alimentam de restos orgânicos), carnívoras, filtradoras, piscívoras (se alimentam de peixes) e onívoras (se alimentam de outros animais e de plantas), contribuem para a ciclagem dos nutrientes e, consequentemente, para o equilíbrio do ecossistema como um todo. Além disso, durante a alimentação, fornecem matéria orgânica (nutrientes) que cai na água e beneficia a microfauna, aumentando a população de peixes. Em particular, as aves piscívoras desempenham importante papel nas teias alimentares, pois retiram das populações os indivíduos de peixes menos aptos, contribuindo para a seleção natural.
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