Наконец-то дошли руки убрать постоянно вылезавшие ошибки в emacs.
Как выяснилось, всего делов-то было - перенести
(setq package-enable-at-startup nil)
(package-initialize)
в начало init.el. Чтоб загружался установленный из elpa org-mode, а не то, что в комплекте самого emacs.
И как обычно - сделать несложно. Сложно - включиться достаточно, чтоб сделать. )