윈도우 파티션의 파일시스템은 NTFS(New Technology File System)으로 보통 구성되어 있다. 예전에는 Ubuntu에서 NTFS 시스템을 읽거나 사용하기 어려웠는데 근래에는 Reverse Engineering을 통해 Ubuntu에서도 사용 가능할 수 있게 되었다. 기본적으로 가장 오래된 시스템은 FAT(File Allocate Table)이며